Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB1P20618 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB1P20618 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PSMB1P20618 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB1P20618 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB1P20618 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB1P20618 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB1P20618 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB1P20618 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB1P20618 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB1P20618 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB1P20618 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB1P20618 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB1P20618 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms