Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms