Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PTPRCP08575 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PTPRCP08575 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PTPRCP08575 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PTPRCP08575 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
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