Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSLP07711 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSLP07711 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSLP07711 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSLP07711 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSLP07711 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSLP07711 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSLP07711 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSLP07711 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSLP07711 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSLP07711 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSLP07711 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSLP07711 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSLP07711 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSLP07711 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSLP07711 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSLP07711 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSLP07711 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSLP07711 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSLP07711 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSLP07711 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms