Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3P05106 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms