Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COCHO43405 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COCHO43405 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COCHO43405 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COCHO43405 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COCHO43405 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COCHO43405 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COCHO43405 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COCHO43405 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COCHO43405 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COCHO43405 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COCHO43405 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COCHO43405 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COCHO43405 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COCHO43405 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COCHO43405 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COCHO43405 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COCHO43405 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COCHO43405 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COCHO43405 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COCHO43405 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COCHO43405 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COCHO43405 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COCHO43405 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COCHO43405 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COCHO43405 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COCHO43405 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
COCHO43405 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COCHO43405 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COCHO43405 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COCHO43405 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COCHO43405 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COCHO43405 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COCHO43405 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COCHO43405 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COCHO43405 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COCHO43405 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COCHO43405 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COCHO43405 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COCHO43405 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms