Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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ARL2-SNX15V9GYD0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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ARL2-SNX15V9GYD0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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