Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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