Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms