Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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HOXC10Q9NYD6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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