Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms