Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms