Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms