Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC2Q96PR1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms