Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA3Q96EY1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms