Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms