Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms