Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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C1orf140Q5VVS0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf140Q5VVS0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf140Q5VVS0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
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C1orf140Q5VVS0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C1orf140Q5VVS0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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C1orf140Q5VVS0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf140Q5VVS0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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C1orf140Q5VVS0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf140Q5VVS0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf140Q5VVS0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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C1orf140Q5VVS0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf140Q5VVS0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf140Q5VVS0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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C1orf140Q5VVS0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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