Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms