Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms