Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Q1T7F1 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
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