Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

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Length 149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CST6Q15828 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CST6Q15828 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CST6Q15828 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CST6Q15828 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CST6Q15828 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CST6Q15828 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CST6Q15828 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CST6Q15828 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CST6Q15828 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CST6Q15828 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CST6Q15828 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CST6Q15828 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CST6Q15828 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CST6Q15828 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CST6Q15828 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CST6Q15828 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CST6Q15828 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CST6Q15828 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CST6Q15828 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CST6Q15828 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CST6Q15828 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CST6Q15828 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CST6Q15828 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CST6Q15828 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CST6Q15828 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CST6Q15828 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CST6Q15828 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CST6Q15828 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CST6Q15828 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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