Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms