Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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