Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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