Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAMK2DQ13557 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CAMK2DQ13557 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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CAMK2DQ13557 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CAMK2DQ13557 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2DQ13557 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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