Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms