Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms