Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms