Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms