Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF1P55201 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms