Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms