Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEPDP12955 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEPDP12955 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEPDP12955 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEPDP12955 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEPDP12955 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEPDP12955 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEPDP12955 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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PEPDP12955 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PEPDP12955 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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