Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3AO14802 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms