Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms