Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms