Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms