Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms