Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms