Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms