Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms