Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFJQ9BTM1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms