Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATG101Q9BSB4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms