Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms