Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CFAP53Q96M91 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP53Q96M91 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms