Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms