Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF501Q96CX3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms