Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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