Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms