Protein–RNA interactions for Protein: Q6W0C5

DPPA3, Developmental pluripotency-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPPA3Q6W0C5 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DPPA3Q6W0C5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms